Localizado no Portal do Amazônia, a 800 Km de Cuiabá, encontra-se o Campus Universitário de Alta Floresta. Foi criado em 23 de setembro de 1991 através do Decreto nº 646, publicado em DOE em 24 de outubro de 1991 entrando em atividade em março de 1992.

O Curso de Ciências Biológicas foi o primeiro curso ofertado e a primeira turma ingressou em 1992. A criação do Curso teve o propósito de estudar e conhecer a biodiversidade da Amazônia Meridional.

Em 2001 foram implantados os cursos de Bacharelado em Agronomia e Engenharia Florestal, atendendo a necessidade de explorar a fronteira agrícola no norte mato-grossense, o manejo florestal e recuperação de áreas degradas. No ano de 2012, atendendo uma reivindicação antiga do Município de Alta Floresta, o Câmpus passa a ofertar o Curso de Direito.

Atualmente são ofertados 04 (quatro) cursos de graduação: Bacharelado e Licenciatura Plena em Ciências Biológicas; Bacharelado em Agronomia, Engenharia Florestal e Direito.

Além dos cursos de Graduação, possui 01 (um) Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Biodiversidade e Agroecossitemas Amazônicos – PPGBioAgro, 01 (um) Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Genética e Melhoramento de Plantas – PGMP (Multicampi) e 01 (um) Doutorado em rede em Biodiversidade e Biotecnologia da Rede Bionorte (PPGBionorte).

Localizado em uma região em desenvolvimento, caracterizada pela rica biodiversidade, apresentada pela Floresta Amazônica, o Campus Universitário de Alta Floresta tem como papel principal o estudo das problemáticas sociais e dos fenômenos físico-ambientais, procurando articular estratégias que possam contribuir para o desenvolvimento sustentado e solidário da sociedade mato-grossense, firmando então o compromisso social da Universidade do Estado de Mato Grosso.