As pesquisas geradas nessa linha proporcionarão a geração de conhecimento sobre a biodiversidade no ecossistema amazônico, aumentando significativamente os indicadores de qualidade ambiental, ao combinar o conhecimento da fauna e flora regional, visando sua conservação e uso, dando suporte para uma nova relação com o meio ambiente e o desenvolvimento de agroecossistemas sustentáveis.

Nesta linha de pesquisa, busca-se o conhecimento integrado de atividades que aproveitem as potencialidades regionais, evitem a degradação ambiental e permitam a exploração sustentável dos agroecossistemas amazônicos.